Magdalena Kozena est lauréate de plusieurs concours, tant en république Tchèque qu'à l'étranger, notamment du sixième Concours international Mozart à Slazbourg (1995).

Elle chante Dorabella (Cosi Fan Tutte) et l'Isabella de L'Italienne à Alger à l'opéra Janacek de Brno et se produit régulièrement aux festivals Le Printemps de Prague et Concertus Moraviae.

Magdalena Kozena chante aussi dans la troupe du Volksoper de Vienne et, en 1998, elle est à Paris dans Paris et Hélène de Gluck au festival de Drottningholm, en Suède.

Récemment, Magdalena Kozena a fait plusieures prises de rôle remarquées : elle a interprété le rôle-titre de l'Orphée de Gluck au Théâtre du Châtelet, sous la direction de John Eliot Gardiner...